DNA提取生物磁珠属于生物生物磁珠的一种,其中心为氧化铁内核,中层包裹封闭基质,外层修饰官能团。应用于DNA吸附与提取纯化的领域,具有一些重要的参数要求,如半沉降时间,磁吸时间,粒径,比表面积,表面官能团密度等。参数的差异不仅会导致操作复杂程度的不同,更会导致提取结果的不同,我们在选择DNA提取生物磁珠的时候,更要注重参数的区别,以下4种参数是选择DNA提取生物磁珠的有效参考。
1、悬浮性
DNA提取生物磁珠虽然具有一定的流动性,能够均匀分散在液体中,跟随液相进入实验体系,但生物磁珠毕竟还是固体,会在液体中以一定速度沉降。所以DNA提取生物磁珠的半沉降时间应在2min以上,才能保证加入生物磁珠时不会因为沉降过快而导致加入量不准确,如果是多样本的操作,对生物磁珠的半沉降时间要求应该更高。生物磁珠良好的悬浮性,可以在操作过程中不用频繁混匀生物磁珠,方便快捷的同时增加了实验的稳定性和均一性。
2、磁吸时间
DNA提取生物磁珠携带目的DNA与体系中杂质分离的过程,主要是通过外加磁场使生物磁珠定向移动并达到固液分离的目的,所以生物磁珠的磁吸时间会影响固液分离的时间,有些品牌的生物磁珠磁吸速度特别慢,这就影响了整体实验效率。DNA提取生物磁珠,磁吸时间均小于30s,适应手动和仪器操作进行核酸纯化的实验频率。
3、比表面积
部分使用DNA提取生物磁珠的实验人员认为粒径越小的生物磁珠比表面积越大吸附效果也越好,这种想法并不*正确。因为生物磁珠表面并不是光滑平整的球面,而是在中间基质层有孔洞,外围修饰集团有凸起的,比表面积并不由粒径大小决定,而且也并不是比表面积越大吸附效果就越好的。有研究表明,当比表面积在60m2/g时,对核酸的吸附效果较好。粒径在300nm左右的生物磁珠包被基质层薄内陷孔洞少,孔容孔径低;粒径在1um左右的生物磁珠包被基质层厚,表面有大量孔洞,两者比表面积都可以达到60m2/g左右。
4、官能基团
一般认为DNA提取生物磁珠表面官能团能越密集,对DNA的吸附效果越好,但考虑到空间位阻、电荷斥力,过高浓度使官能团陷入生物磁珠内部等原因,DNA提取生物磁珠的表面官能团数量并不是越多越好的。适当的降低生物磁珠生产过程中官能团修饰原料,可以很好的控制DNA提取生物磁珠的粒径和吸附量平衡。