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细胞类代谢组学样本收集步骤
  • 发布日期:2018-03-02      浏览次数:4818
    • 适用细胞类型:哺乳动物细胞(CHO、NS0、CD-hybridoma 细胞系)

      样品量要求: 
      1*10 7 cell/sample,提供 2 份样本。  

      样本收集步骤:

      1) 使用细胞计数器测定细胞数量,计算出所需淬灭缓冲液的量。下图以细胞数量1*10 7 为例; 
      NOTE:①使用50ml圆锥形管一次处理样本zui大量为8ml,如果样本量>8ml,就分开做;②淬灭过程时间敏感,两个人操作。 

      2) 将 5 倍样本体积的淬灭缓冲液加入 50ml 圆锥形管中;

      3) 在低温恒温器上预冷淬灭缓冲液至-40℃ (淬灭缓冲液:60%(v/v)甲醇+0.85%(wt/v)碳酸氢铵(pH7.4,使用 12M 的盐酸进行 pH 调节)。如果没有低温恒温器,可以使用干冰代替,并用低温温度计检测温度,保证每管都处于-40℃,温度不能过低); 
      NOTE: 由于单人操作,zui多 2 样本/次,双人操作,4 样/次。保证淬灭处理迅速。因为时间要求“迅速”。 

      4) 吸取 1 体积的细胞样本(1*10 7 ),加入到盛有淬灭缓冲液的管中央。 NOTE: 温度必须维持在-40℃左右,低于 45℃时,会导致细胞破碎。

      5) 缓慢摇晃管子,混匀。 
      NOTE: 禁止 Vortex 涡旋震荡混匀!

      6) 1000g 离心 1min; 

      7) 去除上清。NOTE:当上清被去除干净后,继续贴壁吸取 5s 以保证上清*被去除,因为有些上清粘在壁上,回落的话,会对后继操作带来负面影响。

      8) 使用 200μl -80℃的甲醇将细胞重悬,并转移到 1.5ml 的离心管中,然后用液氮冰冻;

      9) -80 度冻存。足量干冰寄送。  

      注意事项: 

      1)淬灭缓冲液 pH 值要在每次适用前重新测定调整。

      2)温度要控制好,强烈建议使用-40℃冰柜操作。  

      参考文献: 
      Sellick C A, Hansen R, Stephens G M, et al. Metabolite extraction from suspension-cultured mammalian cells for global metabolite profiling.[J]. Nature Protocol, 2011, 6(8):1241-9.

    魏经理
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